Ifølge de skrifter af Yaroslavl historikere Athanasian kloster blev grundlagt efter 1612, på et tidspunkt, hvor nær Kirken Athanasius og Cyril i kapellet har været at finde på mirakuløs ikon af Frelseren. Men der er dokumentation for, at klostret eksisterede allerede i det 16 århundrede I 1615 Gavriil Makushkin, distrikt forstander, der er rettet til den storby i Rostov Cyril til at velsigne Stiftelsen af klostret på det hellige sted.

Der er dokumentation for, at Athanasian kloster blev regeret af et cirkulært. I de første år af sin eksistens har det allerede fået ansættelse og privilegier i henhold til chartre af Mikhail Fedorovich. I det første brev, dateret 1619, blev det sagt, at Athanasian kloster fritaget for Ruga penge og mad, stearinlys, vin, røgelse. Også klosteret blev tildelt en plads under den mølle, der Romanov og Yaroslavl side. Med skov og træ, at klostret var i færd på Volga, Mologa og Sheksna til klostret liv pligt er ikke opkræves. Klostret blev også fritaget for posten som Guvernør, bojarene, prinser og militær folk.

De første bygninger var af træ, i det 17. århundrede blev klostret ødelagt flere gange, i brande. Så, i 1658, klostret blev fuldstændig ødelagt. Den første stenkirke i kloster til ære for Athanasius og Cyril blev bygget i 1664 med velsignelse fra Metropolitan i Rostov-Jonas Sysoyevich. Ved afslutning, Kirken var pyntet med malerier lavet af Moskva mestre. I fire af 1670 klostret igen lidt. I 1676 til Domkirken, og mod Nord blev bygget vinteren Kirke med et klokketårn, som blev indviet i anledning af Metropolitan Alexis i Moskva. I 1736 på foranledning af Abbed i klostret Iona, og ved dekret af Ærkebiskoppen Joachim til Afanasievsky kloster tilskrives kapel er knyttet til det tegn eller udstillingshal af tårnet, som var porten til den Jordiske by. I dag er det kendt som Znamenskaya Kirke.

Athanasian betydelig kloster var aldrig i den rigdom af deres ejendele, eller antallet af munke: i 1717, var der kun syv munke, så man belets; personalet har ikke øget, og i henhold til 1802, klostret var ganske lille, var det begrænset til en lav stenmur lige Øst og Nord-Øst. Andre parter, som hegn var lavet af klostrets udhuse Filisteren huse, samt den Frelser, Probinsya Kirke.

På den Østlige, den forreste facade af det kloster, der havde en Fordeling på gaden, i det 18. århundrede, der er bygget to sten tårne i lille størrelse, den ene af dem spillede den rolle, de Hellige gates, den anden har til huse i et kapel til ære for en vigtig begivenhed − den opdagelse her på mirakuløs ikon. Towers havde spir over med figurer af trumpeting engle.

25 juni, 1768 i centrum af Yaroslavl i ordinær tid branden opstod. På listen over de skader, der er indeholdt i virkeligheden, den første beskrivelse af bygninger Athanasian kloster. Når restaureringen blev opdateret maleri af Kirken af Athanasius og Cyril, den oprindelige sten iconostasis blev erstattet med træ.

I 1820-1830 i klosteret blev udført omfattende arbejde på forbedringer: der blev bygget to-etagers sten Abbot ' s værelser og underskønne; der blev arrangeret to søster celler; til Kirken af Athanasius og Cyril i 1825 håndværkeren Konstantin af Service, der produceres på hans egen bekostning en ny iconostasis, Alexander Chrysikou fra Yaroslavl forgyldt det; i 1831, varme, Kirken var pyntet med malerier, vægmalerier udført Timothy Medvedev. På samme tid, det blev genopbygget enkelt-differentieret bell tower over verandaen varm Kirken, fra den afskaffet kloster af STS sogn blev overført til 115-pounds bell. Ensemblet af klosteret bell tower var syv klokker.

En anden justering Athanasian klostret blev ødelagt ved årsskiftet 19-20 århundreder: i 1897 blev anbragt i en stenkælder, en coach stald, badekar, stabil; i 1903 og 1907. reparation blev udført i Domkirken, med støtte fra F. E. Vakhrameev; i 1912, blev renoveret, vægmaleri kunstner og restaurator M. I. Dikarev på donationer A. Og vahromeeva.

I 1764 ved dekret af Kejserinde Katarina II Afanasyevsk klostret blev anset for at være ubetydelige. December 12, 1857 Afanasyevskaya klostret blev opløftet til tredje klasse grad, abbeder var det denne gang med en vis værdighed (engelsk). Siden 1895 Athanasian kloster fik status af bopæl for en sognepræst Biskoppen i det stift Yaroslavl.

Efter revolutionen, når den Athanasian kloster blev oprettet sogn fællesskabet. I februar 1925 blev klostret lukket, en del af sin ejendom, blev overført til Kirken af Frelseren på Byen og andre templer. I 1930'erne, ved den beslutning, de kommunale myndigheder, tårnet blev revet ned, og Kirken Athanasius og Cyril, og andre klostre bygninger, som husede den organisation, produktion, workshops, broderlige bygningen blev brugt til boliger.

I November 2007, templet med en mur og tårne af de Hellige gates gav den russisk-Ortodokse Kirke. Når Yaroslavl theological Seminary flyttede til herregården vahromeeva ved kendelse af hans Eminence Kirill kloster Kirke blev et Seminar. Januar 31, 2008 i kapellet Alexius blev begået første service.