Fort St. Elmo er den vigtigste befæstning af byen, og er beliggende på spidsen af Cape Valletta. Under den store belejring i 1565, Fortet blev stærkt beskadiget fra de tyrkiske bombardementer og efter sejren var næsten helt genopbygget. Fortet også har lidt meget under Anden verdenskrig. I dag huser national war Museum.

På Museet kan du se den tyske torpedoer og torpedobåde, italienske og tyske anti-tank kanoner, uniformer af det tyvende århundrede, masker, samt på tværs af king George, forfremmet til Malta den 15 April 1942.