Enskibet Church of St. John the Baptist blev undfanget i 1510 velgørere Pardubice – herrer Pernstejnem, der ikke kun overvågede genopbygningen af det lokale slot, at omdanne det til et hyggeligt opholdssted for familien, men heller ikke glemme at ligge under væggene i slottet byen. Tak til Pernstejnem, i Pardubice ikke bygget en Kirke. Var ingen undtagelse, og Kirken indviet ved navn Johannes Døberen.

Opførelsen varede ganske lang tid: om de midler, der var utilstrækkeligt, eller var der andre bekymringer. Endelig, i 1563, Kirken var åben for alle deltagere. Nogle forbedringer af det indre fortsatte i yderligere 7 år. Færdig med opførelsen af Kirken lokal arkitekt Vaclav Vsetecka. Han skabte også Kirkens krypt, som i 1788 sætte tårnet.

For nye Kirke har købt en grund, der var en del af de vigtigste Pardubice kirkegård. For lang tid i nærheden af Kirken for at begrave de døde. Vores dage i perfekt tilstand bevaret nogle gamle grave, som Stammer fra det XVI-XVII århundrede. Nu er de også blevet et lokalt vartegn, og en del af de lokale monumenter, arkitektur og historie.

Over tid, begyndte Kirken at kræve reparation, som blev produceret i 1881. Derefter, i det nye århundrede, blev Kirken igen rekonstrueret. Den sidste betydningsfulde indgriben i sit udseende, fandt sted i årene 1938-1940.

Det indre af Kirken er designet i Barok stil.

Church of St. John the Baptist er i drift, og er åben for offentligheden i løbet af tjenester og kirkelige helligdage.