Ifølge legenden, den navn "midt på bjerget" nedstammer fra nogle degnen Munehisa Misuri, der levede i første halvdel af det 16 århundrede, og som blev kendt for sit velgørende arbejde i forhold til Guds kirker. Respekteret lokal historiker Okulich-Kazarin N. W. valgte den mest plausible version af oprindelsen af navnet på den Kirke, fra små moser, der bærer navnet Maria, fordi disse moser engang i oldtiden og var omgivet af et bjerg.

Opførelsen af en stenkirke fandt sted i 1547. Oprindeligt var Kirken i kloster. I de optegnelser, af scribe bog 1623 nævner mandlige'nikovo kloster kontakt med bjergene. Det er om dette kloster er skrevet i Livet for mineah russiske Metropolitan Makari. Der er en antagelse om, at Abbed Kotelnikova klostret under 60 år af det 16 århundrede var Basilikum-Barlaam, der er forfatter af liv Alexander Nevsky, euphrosynus af Pskov.

I 1808 Kirken var øremærket til nedrivning som en meget gammel, men stadig den Hellige Synode ikke give samtykke til denne handling. I 1882, en købmand fra Pskov Stepnowski Petr Mikhailovich foran døren var der et udhus opført i sten. Under 1892-1896, blev udført reparation og restaurering arbejde på de midler, der af Kirken warden – Kafelnikov Ivan Mikhailovich – æresborger i byen Pskov. Kirken har to altre, der er trone af Evangelist og Apostlen Johannes teologen, og den anden navngivet til ære for den Hellige Martyr John Kriger. Under 1786-1808, Kirken blev tildelt til templet med George of the Hill, og i 1934 han tilskrives Kirken af de Hellige svarende til apostlene Kejser Konstantin og hans mor Helena.

Kirkens tårn blev bygget samtidig med opførelsen af Kirken St. John the Baptist. Klokken blev hængt op med seks klokker. I sognet var der tre kapeller, der er bygget af træ: den Wonderworker og St. Nicholas, nær landsbyen Krastanova, den Hellige Martyr Anastasia og den Ærværdige Martyr Anastasia.

I Church of St. John the Baptist eksisteret hospice, sogn værgemål, hospital, men en snæversynet skolen blev aldrig bygget. I slutningen af det 19. århundrede, i en landsby kaldet Ged Brod blev bygget en Kirke sogn skolen, men snart i 1895 på grund af dets nærhed til andre skoler i byer, at det var lukket.

Rundt om hele Kirken, kirkegården, hvor begravet historiker og forsker i Tzvelev S. A., restaurator Smirnov V. S., samt de soldater, der døde under udførelsen af sin militærtjeneste.

Siden 1913, templet præst Kolobov Fedor. I 1927, efter at han blev arresteret flere gange, Feodor Vasíljevitj blev forvist til Ural. Hustru Kolobov fulgte ham, og efter at eventuelle oplysninger, som ikke indberettes. Degnen var diakon Mikhail Lebedev, men i hans senere liv intet er kendt.

23 December 1936, blev det besluttet at lukke Kirken, men ifølge andre kilder, fortsatte med, indtil den store Fædrelandskrig. Under krigen havde Kirken fået nogle skader på vægge, tage, indvendige og udvendige overflade. Under 1970-1989, under ledelse af arkitekt V. Lebedev A. var en komplet restaurering af Kirken. 3 Marts 1965 kirkegården blev lukket for begravelser.

Den første service begyndte i 1992 på meget indgang til templet. Genoplivning af Church of St. John the Baptist er tæt forbundet med navnet på den berømte Abbed af Iona. Bidraget til restaureringen af Kirken og leder af Pskov kabel anlæg Kukushkin Viktor Petrovitj.
I 2001 Pskov Ærkebiskop Eusebius udførte ritual for indvielse af otte klokkerne, som blev støbt i byen Voronezh, i henhold til den gamle måde. I dag i Kirken en søndag skolen og udført pilgrimsrejse service, som fik status af en stiftets.