Manila-Observatoriet er en non-profit research Institute, der hører til Ateneo de Manila Universitet. Det blev grundlagt i 1865 af Jesuit munke, og i mange år blev brugt til forskellige formål, den vigtigste af disse var og er af vejr og forudsigelse af jordskælv. I dag, Observatoriet gennemfører forskning inden for seismiske aktivitet og undersøgelse af det geomagnetiske felt af jorden.

For første gang spørgsmålet om etablering af Observatoriet blev rejst i 1865, da en munk er en Jesuit Jaime Nonell offentliggjort en artikel, hvori han beskrev observationer af Tyfon i September samme år af en anden munk Jesuit Francisco Kolya. Denne afhandling har tiltrukket sig opmærksomhed fra offentligheden, som appellerede til Abbeden af rækkefølgen af Juan Vidal, at de observationer, der blev videreført. I første omgang var der tvivl om pålideligheden af de modtagne oplysninger af Jesuitterne, som munkene brugte meget primitive værktøjer til vejr. Senere, dog, Vatikanet lovet at erhverve og overføre til de munke, som en gave universal meteorograph Secchi. Således begyndte den systematiske undersøgelse af den Filippinske vejret. I 1879, den munke begyndte at udgive advarsler om den forestående Tyfon, og et år senere begyndte studiet af jordskælv. I 1884, den spanske regering, som er officielt anerkendt af de vigtigste Observatorium Institut for vejrudsigter i Filippinerne. Et år senere startede den tid, tjenesten, i 1887, seismologiske laboratorium, og i 1899 – astronomiske.

I 1901, når kontrol af Filippinerne blev i hænderne på USA, blev Observatoriet ombygget til den Filippinske Weather Bureau, hvis arbejde blev kun afbrudt under Anden verdenskrig. Under en hård Kamp for Manila i 1945 blev alle de vigtige videnskabelige udstyr og dokumenter, blev ødelagt. Kun i 1951, blev Observatoriet i stand til at genoptage sit arbejde, men med meget begrænsede funktioner er dens medarbejdere er involveret i seismologiske forskning i og undersøgelse af Jordens ionosfæren. I 1963, blev Observatoriet overført til Ateneo de Manila Universitet, er en del af, som hun stadig den dag i dag.

Den forskning, aktiviteter for Observatoriet i dag er koncentreret på områder som klimaforandringer, undersøgelse af regionale klima-systemer, geomagnetisk forskning, undersøgelse af dynamikken i solidt på jorden og urban air-kvalitet, osv.