Den Botaniske have blev grundlagt i 1772-1774. Næsten umiddelbart efter dens Fundament, som den blev fusioneret med National history Museum, Skaberen, som var Marquis af Pombal. I stedet for at have blev valgt som Vice-Kansler for Universitetet i Coimbra, Francisco de Lemos. Haven er beliggende på arealer, som tidligere hørte til den Skole af St. Bento placering valley Ursuline. Første kurator på haven var Domingos Vandelli, og i 1791 blev han erstattet af Felix Alawar Brotero, Professor i botanik og landbrug. Haven er hele tiden at udvide, der er nye prøver af planter, og i dag er haven dækker et areal på 13 ha.

Botanisk have ved Universitetet i Coimbra er en af de smukkeste haver i Europa, og består af to dele. En del ligger på en bakke og er opdelt i terrasser. Den nederste terrasse kaldes Quadrado Central-og er den ældste del af haven. Terrassen er indrettet med et springvand 40-erne, kan du se træer plantet under tilsyn af haven Felix Brotero. Indretning af terrassen har en masse til fælles med indretning af Europæiske haver i det attende århundrede. På den anden terrasser kan du se drivhuse med tropiske og subtropiske træer og blomsterbede af hele familier af planter. På disse senge planterne er opdelt i grupper af taxonomisk og er vokset til studiebrug-botanikere, samt for at dele med andre lignende institutioner rundt omkring i verden, der har den Botaniske have.

I den anden del af haven lå dalen, gennem der løber en lille bæk, og hvor arboretum. Der vokser en masse bambus træer og andre eksotiske planter. Også den anden del af haven er berømt for sine fremragende samling af eucalyptus (51 arter). Haven er hjemsted for fugle. Familie brune egern er en del af det økosystem, som med succes blev gennemført i juni 1994. Proteiner var de første dyr, som er tilpasset til miljøet og begynder at formere sig.